慶応元年(1865)

2月23日…山南敬助、切腹。

3月10日…西本願寺に屯所移動。

9月1日…松原忠司、切腹傷悪化で死亡。

11月4日…近藤一行広島へ出立。

12月12日…桜井勇之進、死亡。

慶応2年(1866)

2月12日…河合耆三郎、不算の責によって切腹。

3月某日…近藤一行帰京。

4月1日…谷三十郎、死亡。

7月20日…14代将軍家茂死亡。

9月12日…三条制札事件で土佐藩士藤崎吉五郎斬殺、宮川助五郎捕縛。

12月5日…一橋（徳川）慶喜、15代将軍に正式就任。

12月27日…孝明天皇死亡。

慶応3年(1867)

1月10日…田中知、士道不覚悟により切腹。

1月28日…孝明天皇埋葬に新撰組、幕府歩兵･会津･桑名藩兵と御車の警備に就く。

3月13日…伊東、壬生某所で近藤･土方に分離を語る。

3月20日…伊東ら（藤堂平助）新撰組を離隊。

4月14日…田中寅三脱走。

4月15日…田中、寺町の本満寺に潜伏中を発見され、屯所で切腹。

4月29日…矢口健一郎、切腹。

6月10日…新撰組総員幕府召抱えとなる。

6月14日…茨木司･佐野七五三之助･富川十郎･中村五郎、会津藩邸にて切腹。

6月22日…新撰組離隊の武田観柳斎、竹田街道で斬殺。同士一名逃走。